Manada Chrome Ganso en Chrome con OffiDocs
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DESCRIPCIÓN
ChromeGoose es un complemento del navegador Chrome para la integración de secuencias de comandos de análisis bioinformático, herramientas de visualización y recursos de escritorio y web al permitir el intercambio de datos sin problemas entre todos los componentes.
El análisis de la mayoría de los tipos de datos biológicos requiere diferentes software de análisis de escritorio como Cytoscape, MeV, R, recursos web como NCBI Entrez, EMBL String y scripts personalizados para manipular, analizar y visualizar los datos.
ChromeGoose proporciona un marco unificado para aprovechar la potencia de todos estos componentes conectándolos a través de tipos de datos bien definidos.
Estos tipos de datos incluyen NameList, Matrix, Tuple y Network que fueron definidos previamente por el marco Gaggle.
Varios paquetes de análisis de escritorio, recursos web y scripts personalizados se conectan fácilmente a la arquitectura de ChromeGoose y se evitan todos los problemas de incompatibilidad de datos.
La implementación actual de ChromeGoose integra la conectividad entre Chrome, Cytoscape, MeV y R.
Además, en función del paquete OpenCPU, cualquier script R se puede conectar a este marco con un esfuerzo mínimo.
Ya implementamos tres scripts R para el análisis personalizado de modelos de redes regulatorias, incluido el trazado de datos, el filtrado y la realización de análisis de enriquecimiento.
ChromeGoose es desarrollado por Baliga Lab en el Instituto de Biología de Sistemas.
Información adicional:
- Ofrecido por ning-isb-group-publishing
- Calificación promedio: 4 estrellas (me gustó)
Manada Chrome telaraña de ganso extension integrado con OffiDocs Chromium en línea
