Kawanan Chrome Masuklah Chrome dengan OffiDocs

DESKRIPSI

ChromeGoose adalah plugin browser Chrome untuk integrasi skrip analisis bioinformatika, alat visualisasi, dan sumber daya desktop dan web dengan mengaktifkan pertukaran data yang lancar di antara semua komponen.

Analisis sebagian besar tipe data biologis memerlukan perangkat lunak analisis desktop yang berbeda seperti Cytoscape, MeV, R, sumber daya web seperti NCBI Entrez, EMBL String, dan skrip khusus untuk memanipulasi, menganalisis, dan memvisualisasikan data.

ChromeGoose menyediakan kerangka kerja terpadu untuk memanfaatkan kekuatan semua komponen ini dengan menghubungkannya melalui tipe data yang terdefinisi dengan baik.

Tipe data ini termasuk NameList, Matrix, Tuple dan Network yang telah didefinisikan sebelumnya oleh framework Gaggle.

Berbagai paket analisis desktop, sumber daya web, dan skrip khusus mudah dipasang ke arsitektur ChromeGoose dan semua masalah ketidakcocokan data dapat dihindari.

Implementasi ChromeGoose saat ini mengintegrasikan konektivitas antara Chrome, Cytoscape, MeV dan R.

Selain itu, berdasarkan paket OpenCPU, skrip R apa pun dapat dipasang ke kerangka kerja ini dengan sedikit usaha.

Kami telah mengimplementasikan tiga skrip R untuk analisis kustom model jaringan pengaturan termasuk perencanaan data, pemfilteran, dan melakukan analisis pengayaan.

ChromeGoose dikembangkan oleh Baliga Lab di Institute for Systems Biology.

Informasi tambahan:

- Ditawarkan oleh ning-isb-group-publishing
- Peringkat rata-rata: 4 bintang (menyukainya)

Kawanan Chrome Jaring angsa extension terintegrasi dengan OffiDocs Chromium secara online