Gag Chrome Oca dentro Chrome con OffiDocs

DESCRIZIONE

ChromeGoose è un plug-in del browser Chrome per l'integrazione di script di analisi bioinformatica, strumenti di visualizzazione e risorse desktop e Web consentendo lo scambio di dati senza interruzioni tra tutti i componenti.

L'analisi dei tipi di dati più biologici richiede diversi software di analisi desktop come Cytoscape, MeV, R, risorse Web come NCBI Entrez, EMBL String e script personalizzati per la manipolazione, l'analisi e la visualizzazione dei dati.

ChromeGoose fornisce un framework unificato per sfruttare la potenza di tutti questi componenti collegandoli tramite tipi di dati ben definiti.

Questi tipi di dati includono NameList, Matrix, Tuple e Network definiti in precedenza dal framework Gaggle.

Vari pacchetti di analisi desktop, risorse Web e script personalizzati possono essere facilmente inseriti nell'architettura di ChromeGoose e tutti i problemi di incompatibilità dei dati vengono evitati.

L'attuale implementazione di ChromeGoose integra la connettività tra Chrome, Cytoscape, MeV e R.

Inoltre, sulla base del pacchetto OpenCPU, qualsiasi script R può essere inserito in questo framework con il minimo sforzo.

Abbiamo già implementato tre script R per l'analisi personalizzata dei modelli di rete di regolamentazione, tra cui il tracciamento dei dati, il filtraggio e l'esecuzione di analisi di arricchimento.

ChromeGoose è sviluppato dal Baliga Lab dell'Institute for Systems Biology.

Informazioni aggiuntive:

- Offerto da ning-isb-group-publishing
- Valutazione media: 4 stelle (è piaciuto)

Gag Chrome Rete d'oca extension integrato con OffiDocs Chromium online