гоготание Chrome Гусь в Chrome с ОфиДокс

ОПИСАНИЕ

ChromeGoose — это подключаемый модуль браузера Chrome для интеграции сценариев биоинформатического анализа, инструментов визуализации и настольных и веб-ресурсов, обеспечивающий беспрепятственный обмен данными между всеми компонентами.

Для анализа большинства типов биологических данных требуется различное программное обеспечение для настольного анализа, такое как Cytoscape, MeV, R, веб-ресурсы, такие как NCBI Entrez, EMBL String, и специальные сценарии для обработки, анализа и визуализации данных.

ChromeGoose предоставляет единую платформу для использования возможностей всех этих компонентов, соединяя их через четко определенные типы данных.

Эти типы данных включают NameList, Matrix, Tuple и Network, которые ранее были определены инфраструктурой Gaggle.

Различные пакеты анализа рабочего стола, веб-ресурсы и пользовательские сценарии легко подключаются к архитектуре ChromeGoose, что позволяет избежать всех проблем с несовместимостью данных.

Текущая реализация ChromeGoose объединяет возможности подключения между Chrome, Cytoscape, MeV и R.

Кроме того, на основе пакета OpenCPU любые R-скрипты могут быть подключены к этой платформе с минимальными усилиями.

Мы уже внедрили три сценария R для пользовательского анализа моделей регулирующей сети, включая построение графиков данных, фильтрацию и выполнение анализа обогащения.

ChromeGoose разработан лабораторией Baliga Lab Института системной биологии.

Дополнительная информация:

- Предлагается ning-isb-group-publishing
- Средняя оценка: 4 звезды (понравилось)

гоготание Chrome Гусиная паутина extension интегрирован с OffiDocs Chromium онлайн